工学院位于南京市浦口区，南临长江，北依秀丽的老山。现有教职工450多人，全日制在读本科生5000余人，博士、硕士研究生近400人，成人教育学生500多人。六十年多来，培养了包括专家、学者、企业家、党政管理等各类人才3万余人。
现有农业机械化系/交通与车辆工程系、机械工程系、电气工程系、管理工程系、基础课部和培训部等教学单位。设有农业机械化及其自动化、交通运输、工业设计、机械设计制造及其自动化、农业电气化、电子信息科学与技术、自动化、工业工程、工程管理、物流工程、车辆工程、材料成型及控制工程等12个本科专业。农业机械化及其自动化专业为国家级特色专业，农业电气化为省级特色专业。《农业机械学》、《汽车拖拉机学》被评为国家精品课程。
设有农业工程博士后流动站，农业工程一级学科博士学位授权点，农业工程、机械工程、管理科学与工程一级学科硕士学位授权点和检测技术与自动化装置二级学科硕士学位授权点以及工程硕士(农业工程、机械工程和物流工程领域)和农业硕士(农业机械化领域)专业学位授予权。
长期以来，学院瞄准国家战略目标和社会发展需求，依托农业工程优势学科，在现代农业装备理论与技术、土壤-机器系统、耕种收农业机械设计、拖拉机电液控制技术、设施农业环境模拟与控制、先进制造技术、农村能源等领域开展重点攻关，研究成果受到国内外瞩目。近五年，承担国家科技支撑、国家863计划等各类项目100多项，获国家、省部级科研成果奖6项，发表学术论文1000多篇，被SCI、EI、ISTP收录300多篇，出版著作、教材近百部。
学院高度重视学生实践能力和创新能力培养。建立国家级、省级、校级、院级四层次的大学生科研训练计划体系，每年立项约160项科研训练计划。组织学生参加全国大学生方程式汽车大赛、中国机器人大赛、全国大学生电子设计竞赛等30余项课外学术科技竞赛。为学生搭建课内自主学习，课外自主科研训练的广阔平台，提高了大学生的科研素质、实践能力、创新能力以及就业竞争力。
面向未来，按照学校党代会提出的建设世界一流农业大学奋斗目标，学院秉承学校百年办学传统，践行“诚朴勤仁”校训，发扬艰苦奋斗、务实奋进的优良传统，营造团结融洽、和睦和谐的校园文化氛围，发挥农业工程学科优势，坚持以工为主、理工结合、农工融合，为建设有特色高水平学院努力奋斗。
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