软件学院成立于2002年4月27日，是教育部、原国家计委批准成立的全国37所国家示范性软件学院之一。发展目标为：“创办一所能够在一种新的办学机制下，规模培养全面和谐发展的、创新型的、国际化的、市场急需的工程实用性人才的国内一流学院。”十年来，北航软件学院一直秉承示范性软件学院的办学宗旨，积极探索，勇于创新，办学特色鲜明。目前已向软件行业输送毕业生4000余人。深受市场欢迎，学生就业质量高，本科生就业率达到99%以上，免试推荐攻读研究生比例约20%，在国内继续攻读硕士研究生占总人数35%以上，出国留学比例15%。学院的软件工程研究生规模达数千名，除了在软件工程传统方向上极具优势外，还在新兴的移动互联网、云计算、互联网营销、大数据技术与应用等领域处于国内领先地位。
软件学院本科按软件工程一级学科招生，培养面向国民经济信息化建设和发展需要、面向企事业单位对各类软件工程人才需求的“高层次、实用性、复合型、国际化”的软件工程技术和管理人才。课程体系设置参照美国ACM和IEEE计算机协会联合推荐的课程体系，结合当前IT市场对人才的需要，兼顾基础性和前沿性、理论性和技术性、人文与科学等多个方面，突出培养学生的工程意识、职业素养和实践能力，强调企业实训环节。该专业下设多个专业方向，2007年软件工程方向、嵌入式系统方向、软件外包方向被评为教育部特色专业方向。在2012年教育部第三次学科评估中，北航软件工程学科全国排名第四，强有力的学科建设为该专业办学提供了有力的支持。
作为示范性软件学院，创新是学院生存的基石，也是学院的办学特色。专业培养中，通过一系列教学环节鼓励和培养学生的创新、创意和创业精神。在培养阶段实行差异化的培养，实行本科生导师制，推行小班化授课，开设创新创意课程，并以冯如杯、ACM竞赛和国内外知名科技竞赛为载体，引导学生参加科技创新活动，让每一个学生在本科毕业前都创造至少一件完整的软件作品。邀请科学家、企业家和杰出校友举办创新、创意和创业讲座，营造创新、创意和创业氛围，并为有创新成果和创业基础的学生设置专项奖学金。为此，软件学院的学生除了有机会享受到学校各类奖学金以外，还可以申请学院设置的高额创新奖学金，实现自己的创新、创业梦想。
自2012年，学院成立“软件先锋”本科生实验班，培养未来的软件先锋和IT创新精英。该班计划在一年级结束时从学院学生中选拔，实行本硕连读（6年），提供高额的奖学金和助学金（包括本硕学费和各类助研金，累计近10万元），邀请行业领军人物作为学生的“人生和创新创业导师”，引导和指导学生的成长。
同时，学院实行助研计划(RA-ResearchAssistantPlan)。针对有科研兴趣和潜力的同学，在高年级进入导师的实验室，并免试推荐攻读研究生，在导师指导下专注于科学与关键技术研究、项目研发、产品设计等专业探索。学院提供高额的助研奖学（包括免除研究生的全部学费、发放科研津贴和各类优秀奖学金）。
学院与国际国内知名软件企业开展深度校企合作，设立了专业实验室和学生实习基地，目前已建设了北航-威盛电子集成电路设计专用实验室、AMD-北航学生科技创新中心、MercuryInteractive（美国）软件质量保障和测试实验室、SAP-北航ERP实验室、北航GoogleCamp实验室、三创中心实验室、国家Linux技术培训与推广中心实验室、Adobe—北航软件学院—Uniquedu‘移动云计算’RIA开发联合实验室、联想集团—北航软件学院—Uniquedu“移动云计算”联合实验室、HTC—北航软件学院—Uniquedu“移动云计算”联合实验室、百度—北航软件学院—Uniquedu“互联网营销”联合实验室等20多个企业联合实验室。还与Microsoft、Google、Oracle、TCS、EMC、HP、NEC、VIA、IBM、SAP、MercuryInteractive、瑞典IAR公司、威盛电子、AMD、时代集团、富士通、联想、用友、大唐等数十家国内外知名企业结成校企联盟，建立实习基地、派遣学生实习，并共建精品课程、联合进行师资培训、设立企业奖学金、进行项目合作等。
学院改革基础课教学方式，加大外语应用能力培养力度，大多数专业课程使用国际上优秀的原文教材，鼓励英语与汉语双语授课、以及全英语授课，并注重同国外知名大学进行联合办学。同美国、加拿大、日本、新加坡等国家的著名高校建立了深入而广泛的合作。每年选派30名左右本科生出国实习或作为交换学生，拓展学生视野和培养学生跨文化交流能力。
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