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药学院前身为山西医科大学药学系，创建于1979年，同年开始招收药学专业学生。1999年经国家教委批准更名为山西医科大学药学院。

学院以本科教育为主，现有药学、药物制剂、中药学三个本科专业。药学专业是教育部高等学校特色专业建设点、山西省品牌专业，药物制剂专业是山西省特色专业。学院设有药物化学、药剂学、临床药学、中药学和药物分析学5个综合教研室。为了适应不同专业学生的更高要求，学院成立了药学实验教学中心，下设4个综合实验室、1个药学实训中心和中药标本馆。学院是一个拥有多层次药学专门人才培养模式，集教学、科研与开发、社会服务为一体的教育机构，1987年开始招收硕士研究生，现有临床药学二级学科博士点、药学一级学科硕士点、中药学一级学科硕士点和药学专业学位硕士点。目前在校本科生800余人，研究生120余人。学院还设有山西省中医药现代工程技术研究中心、山西省药学研究生教育创新中心和山西省执业药师培训基地。

学院师资力量雄厚，现有教职工59人。其中，教授11人、副教授15人；博士生导师1人、硕士生导师23人；“新世纪百千万人才工程”国家级人选1人；国务院政府特殊津贴专家1人；省级特聘教授1人；山西省教学名师2人；山西省高校创新拔尖人才2人；山西省青年学术带头人1人；教育部优秀骨干教师和新世纪优秀人才各1人；省高校首批青年学术带头人及骨干教师各2人；具有博士学位和硕士学位者占教师总人数的96%。

近3年来，学院教师主持的科研项目共60余项，其中10项国家级重点科研项目（包括国家科技重大专项、国家863计划、国家自然科学基金项目、国家支撑计划项目和国家教育部高等学校优秀骨干教师项目等）。取得了省部级科技成果奖6项、省教学成果奖2项；获国家发明专利30余项，欧盟发明专利2项，出版学术专著5部，在国内外核心专业刊物上发表了较高水平的学术研究论文200余篇，被SCI收录70多篇。

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